Биопсия крови может предлагать более полную генетическую информацию, чем тесты костного мозга, показывает исследование

        

Биопсии костного мозга являются золотым стандартом для диагностики и мониторинга прогрессирования множественной миеломы, но эти процедуры слишком инвазивны для выполнения при каждом посещении пациентов. Однако ученые из Института рака Дана-Фарбера и Большого института Массачусетского технологического института и Гарварда показали, что два способа измерения множественной ДНК миеломы в образцах крови обеспечивают очень подробные наборы генетической информации, которые хорошо согласуются не только друг с другом, но и с результатами от испытаний костного мозга.

«До сих пор у нас не было хорошего способа измерить, как несколько популяций клеток миеломы развиваются с этапов предшественника на диагностированную болезнь, а затем реагируют на лечение, – говорит Ирен Гобриан, доктор медицины, медицинский онколог Дана-Фарбер». Это то, где биопсии крови могут иметь огромное значение – расширить наше понимание множественной миеломы и действительно дать нам график того, как болезнь прогрессирует и реагирует на терапию ».

Совместное исследование исследовало биопсию крови, которая собрала множественную ДНК опухоли миеломы из двух источников. Один из них представляет собой циркулирующую свободную ДНК (кДНК), отходы ДНК, высвобождаемые в кровоток с помощью умирающих клеток. Другой – циркулирующие опухолевые клетки (КТК) – сами клетки миеломы.

«Наше открытие, что анализы cfDNA и CTC согласуются друг с другом на всеобъемлющем уровне, является важным нахождением, поскольку это означает, что рутинное генетическое профилирование опухолей пациентов из крови было бы осуществимым», – говорит Гобриан, со-старший автор бумага, сообщающая о работе в Nature Communications .

Анализ биопсии крови следовал за двухступенчатым секвенированием, говорит Виктор Адальстейнссон, кандидат наук, руководитель группы по биопсии крови в Broad Institute и со-старший автор на бумаге. Первым шагом, разработанным его командой и названным секвенированием цельного генома «ультранизкий проход», был рентабельный метод определения образцов крови с фракцией опухолевой ДНК не менее 5-10%, что позволило провести более полный генетический анализ. На втором этапе исследователи выполнили целые последовательности exome (анализируя кодирующие белок области генома) на этих образцах.

Исследователи исследовали cfDNA у 107 пациентов и КТК у 56 пациентов. Затем ученые сопоставили cfDNA с данными костного мозга у девяти пациентов и сравнили все три формы биопсии у четырех дополнительных пациентов. В целом, профили генов тесно связаны друг с другом, демонстрируя, например, 99% -ное согласие между биопсией жидкости и костного мозга для мутаций гена опухоли.

. Такие высокие уровни согласия предполагают, что две формы жидкой биопсии могут быть взаимозаменяемы для отслеживания пациентов с множественной миеломой, говорят исследователи, и использование обоих методов может еще больше увеличить шансы на понимание заболевания у каждого пациента.

]

Также возможно, что биопсии в крови будут предлагать более полную генетическую информацию, чем тесты на костный мозг, говорит Саломон Манье, доктор медицины, доктор философии, первый автор на бумаге и бывший аспирант в лаборатории Гоббрия.

Знание всего генетического спектра болезни имеет решающее значение для индивидуализации лечения, особенно учитывая растущее число терапевтических вариантов множественной миеломы, указывает Манье. Но биопсии костного мозга собирают клетки только из одного места, поэтому эти тесты могут пропустить близлежащие клетки с совершенно разными характеристиками.

«Мы не можем делать индивидуальную медицину с помощью одной биопсии костного мозга», – говорит он. «Нам нужны эти биопсии крови, чтобы помочь в лечении, потому что опухоли пациентов меняются со временем».

Исследователи подчеркивают, что результаты их исследования должны быть подтверждены в более крупных группах пациентов, в настоящее время продолжающихся, до того, как биопсии крови могут быть приведены в клиническое использование.

Среди их следующих шагов ученые стремятся разработать методы, которые предоставляют более подробную и клинически соответствующую генетическую информацию, и методы оттачивания, которые работают в образцах крови с более низкими фракциями раковой ДНК. «Наша конечная цель состоит в том, чтобы в конечном итоге использовать все образцы для мониторинга прогрессирования болезни», – говорит Jihye Park, доктор философии, исследователь в лаборатории Ghobbrial и один из первых авторов на бумаге.

«Технология в основном существует, говорит Гоббриаль.« Наши пациенты так рады видеть эти тесты, и теперь нам нужно разработать клинические инструменты, которые станут частью рутинного тестирования ».

«Эти неинвазивные методы действительно могут открыть дверь для продольного исследования эволюции и прогрессирования рака», – говорит Адальстейнссон, чья группа преследует множество проектов, чтобы всесторонне упорядочить солидные опухоли, а также рак крови. «Мы считаем, что важно широко смотреть на геном рака пациента и то, как он изменяется с течением времени, – идентифицировать не только известные действующие мутации сегодняшнего дня, но и открывать новые, которые будут информировать о более эффективном и эффективном лечении завтрашнего дня»

Источник:

http://www.dana-farber.org/

      

Source link