Ген, связанный с высокой летальностью, может быть использован в качестве биомаркера у пациентов с инфекцией P. aeruginosa

        

Исследователи обнаружили легко измеряемый ген, связанный с высокой летальностью, который можно было бы использовать в качестве нового прогностического биомаркера у пациентов с инфекцией кровотока Pseudomonas aeruginosa P. aeruginosa ) , согласно исследованиям, представленным на 28-м Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным заболеваниям (ECCMID).

Новые результаты, представленные профессором Маттиасом Виллманном из Института медицины и гигиены в Тюбингенском университете в Германии, идентифицировали такие биомаркеры, изучая генетические характеристики и данные генной экспрессии P. aeruginosa штаммов у пациентов с инфекцией кровотока.

«Мы идентифицировали нового и клинически значимого кандидата вирулентности вируса в P. aeruginosa . Генотип helP подходит для использования в клинической практике из-за его адекватной прогностической способности и легкости измерения».

Существует ограниченное понимание факторов вирулентности возбудителя, факторов, определяющих тяжесть болезнетворных микробов, которые могут быть полезны при определении результатов лечения и возможных целей лечения. Уиллманн пояснил, что до настоящего времени исследования биомаркеров, независимо от типа биомаркера (диагностические и прогностические), в основном были сосредоточены на биомаркерах, полученных из организма пациента, но пренебрегали биомаркерами, получавшими патогенез.

«Возможно, это была огромная ошибка. Бактерии, подобные Pseudomonas aeruginosa могут иметь большой геном с несколькими тысячами генов. Штаммы одного и того же вида могут даже отличаться на сотни из них», – сказал Уиллманн. «Весьма вероятно, что эти геномные различия способствуют различной степени бактериальной патогенности и, следовательно, к другому клиническому исходу».

Команда использовала цельное геномное секвенирование, процесс, позволяющий определять всю ДНК организма, начиная с первой культуры крови каждого пациента и так называемой количественной протеомики, которая используется для определения количества белков в образцах , Исследователи использовали многоуровневый регрессионный анализ Кокса, чтобы определить, сколько времени потребуется для определенных событий. Это дало исследователям понимание уровня смертности, основанного на характеристиках каждого пациента, и P. палочки .

Команда Уильманна проанализировала 2 298 аксессуарных генов, а также 1,078 основных уровней белка и 107 вариаций тяжести и факторов эффективности антибиотиков. Они смогли идентифицировать несколько кластеров, одна из которых была связана с более высоким риском смерти пациентов. Подойдя ближе к этому кластеру, один конкретный ген, гейказа DEAD-box RNA, названный help, имел отношение риска 2,01, что означало, что смертельный исход был в два раза более вероятным по сравнению с контрольной группой.

«В случае высокого риска, который будет отмечен присутствием или высоким содержанием биомаркера, врачи могут реагировать рано», – пояснил Уиллманн, добавив, что «это может быть связано с увеличением контроля пациента (путем перевода в ОИТ единиц) или путем введения комбинированного лечения антибиотиками вместо монотерапии ».

Из-за местонахождения гена help было определено, что helP также переносится на другие штаммы и даже виды, что может привести к тому, что другие бактерии станут более вирулентными.

«Точно так же, как мы не хотим распространять множественную лекарственную устойчивость, это должно быть целью уменьшить распространение очень патогенных штаммов», – сказал Уиллман. «Это особенно характерно, если фактор вирулентности, который опосредует повышенную патогенность, расположен на мобильном генетическом элементе и поэтому может быть перенесен на менее патогенную бактерию, которая затем может получить более высокую патогенность. С этой точки зрения наши результаты также важное значение для контроля инфекции ».

      

Source link