Исследование показывает основные критерии, определяющие эффективность двух типов нанопор в обнаружении сахарных цепей

. Нанопы белка представлены в клеточных мембранах и служат в качестве биологических шлюзов. Это означает, что они также могут быть использованы для обнаружения определенных биоактивных молекулярных цепей, таких как сахарные цепи, такие как молекулы из группы гликозаминогликанов. Последние отвечают за важнейшие взаимодействия на уровне клеток. Они обычно облегчают взаимодействие с поверхностями клеток или белками, вызывая активацию патологических и физиологических эффектов в эмбриональном развитии, воспалительную реакцию, рост и дифференцировку клеток, микробную инфекцию и рост опухоли.

Использование таких нанопор, как биосенсоры, необходимо для полного понимания сложных механизмов, происходящих в результате прохождения через них цепочек сахара. В новом исследовании, опубликованном в EPJ E, Азиз Феннури из Университета Париж-Саклай в Эври (Франция) и его коллеги излагают основные критерии, определяющие эффективность двух типов нанопор в цепочках обнаружения сахарных цепей.

Исследователи конкретно исследуют, как два нанопориста белка на основе 10 нанометров, а именно α-гемолизин (α-HL) от Staphylococcus aureus и aerolysin (AeL) от Aeromonas hydrophila, влияют на способность компонентов сахарной цепи больших биомолекул, таких как гиалуроновой кислоты, чтобы пройти через нанопоры.

Исследователи узнали, что, когда сахарные цепи входят из широкого конца воронки, составляющей каждую поры, AeL можно использовать для восприятия коротких цепочек сахара. С другой стороны, α-HL не воспринимает такие короткие цепи, потому что они очень быстро пересекают нанопоры. Противоположность имеет место, когда сахарные цепи расположены на тонком конце воронкообразной пор.

Эти результаты показывают, что выбор нанопора, используемого для проведения экспериментов по биосенсии, жизненно важен. Критерии, отличные от внутреннего диаметра пор, должны учитываться при разработке биосенсоров, чтобы сделать их идеальным для обнаружения. Другие параметры, которые следует учитывать, включают перераспределение зарядов в поры, геометрию канала пор и возможные взаимодействия, происходящие на внутренней стенке канала пор

Источник: https://www.springer.com

Source link