Новый метод позволяет выявлять непосредственные взаимодействия биомолекул

        

Белки – это строительные блоки клетки. Они выполняют большую часть работы и имеют важное значение для структуры, функции и динамической регуляции тканей и органов клетки и тела. Белки редко работают одни, они взаимодействуют, образуют белковые комплексы или связывают ДНК и РНК, чтобы контролировать, что делает клетка. Эти комплексы являются ключевыми частями многих важных реакций внутри клетки, таких как энергетический метаболизм или регуляция генов. Любое изменение в тех взаимодействиях, которое может быть вызвано, например, мутацией, может иметь значение между здоровьем и болезнью. Следовательно, для понимания того, как функционируют клетки, или что может пойти не так в больных клетках, важно знать, как взаимодействуют их строительные блоки.

Новые технологии позволили ученым в течение последних десятилетий понять генетическую информацию, которую обладает организм, которая из этой информации активно используется и какие белки производятся клеткой в ​​разных обстоятельствах. Теперь большой проблемой является понимание того, как биомолекулы, такие как белки и молекулы-мессенджер РНК, объединяются, чтобы сформировать комплексы, необходимые для функциональной клетки. Другими словами, мы знаем, что десять тысяч частей, которые построена ячейка, но мы не знаем, как они принадлежат друг другу.

В статье, опубликованной в Nature Communications ученые из Центра геномного регулирования (CRG) описывают разработку нового метода под названием «rec-YnH», который был разработан для понимания образованных комплексов между сотнями белков и РНК в то же время.

Метод, развитие которого возглавлял Себастьян Маурер в сотрудничестве с лабораторией Луиса Серрано, является первым методом, который позволяет одновременно обнаруживать взаимодействия между большим количеством белков и молекул РНК. Исследователи сделали акцент на разработке приемлемого и доступного метода, который широко применим.

«Наш метод надежно измеряет взаимодействия между многими белками или многими белками и фрагментами РНК без необходимости в дорогостоящем специализированном оборудовании», – объясняет Себастьян Маурер. «Эта методология может быть использована любой стандартной биомедицинской исследовательской лабораторией и будет полезна для изучения конкретного процесса в клетке, а также для исследователей, которые должны одновременно исследовать миллионы белковых взаимодействий, чтобы искать комплекс, связанный с конкретным заболеванием», он заключает.

Две лаборатории CRG успешно объединили свои знания в области биоинформатики, биохимии и молекулярной биологии для реализации и проверки метода. «Наше сотрудничество привело к доступному и доступному методу, который дает высококачественные карты протеино-белковых и белково-РНК-взаимодействий», – говорит Дже-Сон Ян, докторант-исследователь и один из первых авторов этой статьи.

«Взаимодействия между белками и РНК являются ключевыми для многих биологических процессов, включая регуляцию генов, и наш метод является первым, который может одновременно обнаруживать взаимодействия между сотнями белков и РНК. Наличие такого эффективного нового инструмента будет чрезвычайно полезно для ответа на важные вопросы, связанные со многими заболеваниями », – заявляет первый автор исследования и исследователь CRG Мирея Гаррига.

Источник:

http://www.crg.eu/en/news/you-are-company-you-keep

      

Source link