Ученые TGen разрабатывают новый контроль качества для выявления рака от образца крови пациента

        

Представьте, сколько пациентов может принести пользу, если вы обнаружите наличие рака, и даже, как этот рак развивается с течением времени, с простым анализом крови.

Существует огромный потенциал в методах прецизионной медицины как для обнаружения, так и для наблюдения за болезнями путем поиска признаков мутаций рака в бесклеточной ДНК (cfDNA), обнаруженной в крови. Однако есть много факторов, которые могут значительно изменить эти образцы, поскольку они собираются и анализируются.

Чтобы помочь оценить и обеспечить качество этих молекулярных биомаркеров, научная группа, возглавляемая Исследовательским институтом трансляционной геномики (TGen), разработала быстрый тест – анализ цифровой ПЦР (ddPCR) с каплями – так что эти образцы могут быть используется для определения наличия и прогрессирования заболевания.

Этот новый тест показал многообещающие результаты, помогая оценить биомаркеры cfDNA в нескольких типах рака, включая меланому, холангиокарциному (рак желчных протоков), рак прямой кишки и рак молочной железы, согласно исследованию, опубликованному сегодня в журнале Scientific Reports .

«Для того, чтобы мы полагались на последовательность результатов и доказательств мутаций рака из этих образцов и для принятия правильных рекомендаций для лечения врачей, мы должны убедиться, что они были собраны и обработаны надлежащим образом», – сказал д-р Мухаммед Муртаза, Директор Центра неинвазивной диагностики TGen, исследователь в кампусе Аризоны Клиники Майо и старший автор исследования. «Мы разработали этот новый контроль качества, чтобы убедиться, что мы можем подтвердить надежность с использованием очень небольшого объема образца крови пациента».

Например, cfDNA в крови может быть загрязнена, если клетки периферической крови разрываются, высвобождая более длинные фрагменты ДНК, не предназначенные как часть показания, которые затем могут смещать результаты.

Новый тест TGen может отфильтровать такие переменные и оценить количество и качество образцов cfDNA крови, чтобы улучшить производительность последующих тестов секвенирования, в которых можно рассчитать и проанализировать миллиарды точек данных в ДНК.

]

. Хотя консенсус профессиональных медицинских экспертов заключается в том, что эти типы тестов на циркулирующую опухолевую ДНК (ктДНК) еще недостаточно усовершенствованы для использования вне клинических испытаний, новый анализ TGen является значительным шагом на пути к созданию так называемых жидких биопсий рутинный, неинвазивный и точный метод скрининга на рак, выявление рака на ранних стадиях, принятие решений о лечении и мониторинг эффективности лечения.

«Мы теперь регулярно используем этот анализ для оценки качества всех образцов плазмы, обработанных и проанализированных для исследований ctDNA в нашей лаборатории», – сказал Хавелл Маркус, член лаборатории доктора Муртазы и ведущий автор исследования.

Также в этом исследовании участвовали: Клинический центр клиники Майо для индивидуализированной медицины, Оксфордский университет, Центр лечения рака в Северном Уэльсе, Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе и Йельский университет.

Д-р. Муртаза и Таня Контей-Куомо, член лаборатории доктора Муртазы, а также автор исследования, подали заявку на патент для анализа ddPCR.

Источник:

https://www.tgen.org/news/2018/may/09/tgen-develops-quality-control-test-for-detecting-cancer -в-крови /

      

Source link