Данные секвенирования РНК выявляют три основных молекулярных подтипа болезни Альцгеймера

Данные секвенирования РНК выявляют три основных молекулярных подтипа болезни Альцгеймера

Исследователи из Медицинской школы Икана на горе Синай идентифицировали три основных молекулярных подтипа болезни Альцгеймера (БА), используя данные секвенирования РНК. Исследование продвигает наше понимание механизмов AD и может проложить путь для разработки новых, индивидуализированных терапевтических средств.

Работа финансировалась Национальным институтом старения, входящим в состав Национальных институтов здравоохранения (NIH), и опубликована в Science Advances 6 января 2021 года.

РНК – это генетическая молекула, подобная ДНК, которая кодирует инструкции по созданию белков. Секвенирование РНК – это технология, которая выявляет присутствие и количество РНК в биологическом образце, таком как срез мозга.

Болезнь Альцгеймера – наиболее распространенная форма деменции, но она весьма разнообразна по своим биологическим и патологическим проявлениям. Появляется все больше свидетельств того, что прогрессирование болезни и реакция на вмешательства значительно различаются у пациентов с болезнью Альцгеймера. У некоторых пациентов когнитивное снижение снижается медленно, у других – быстро; у некоторых наблюдается значительная потеря памяти и неспособность запоминать новую информацию, а у других – нет; и некоторые пациенты испытывают психоз и / или депрессию, связанные с БА, в то время как другие нет.

«Такие различия убедительно свидетельствуют о существовании подтипов БА с различными биологическими и молекулярными факторами, влияющими на прогрессирование заболевания», – сказал Бинь Чжан, доктор философии, ведущий автор исследования, директор Центра моделирования трансформирующих заболеваний и профессор генетики. и геномные науки в Медицинской школе Икана

Чтобы идентифицировать молекулярные подтипы БА, исследователи использовали подход компьютерной биологии, чтобы выявить взаимосвязь между различными типами РНК, клиническими и патологическими признаками и другими биологическими факторами, которые потенциально способствуют развитию болезни. Исследовательская группа проанализировала данные секвенирования РНК более чем 1500 образцов из пяти областей мозга от сотен умерших пациентов с БА и здоровой контрольной группы и определила три основных молекулярных подтипа БА. Эти подтипы БА не зависели от возраста и стадии заболевания и были воспроизведены во многих областях мозга в двух когортных исследованиях.

Эти подтипы соответствуют различным комбинациям множества нерегулируемых биологических путей, ведущих к дегенерации мозга. Нейрофибриллярный клубок тау-белка и бета-амилоид-бляшка, два невропатологических признака БА, значительно увеличиваются только в определенных подтипах.

Многие недавние исследования показали, что повышенный иммунный ответ может способствовать развитию болезни Альцгеймера. Однако более половины головного мозга с БА не демонстрируют повышенного иммунного ответа по сравнению с нормальным здоровым мозгом. Дальнейший анализ выявил специфичные для подтипа молекулярные драйверы прогрессирования БА в этих образцах.

Исследование также выявило соответствие между этими молекулярными подтипами и существующими моделями животных с БА, используемыми для механистических исследований и для тестирования терапевтических кандидатов, что может частично объяснить, почему подавляющее большинство лекарств, которые успешно применялись на определенных мышах, не прошли испытания БА на людях. , участники которого, вероятно, принадлежали к разным молекулярным подтипам.

Хотя подтип, описанный исследователями, был выполнен посмертно с использованием ткани мозга пациентов, исследователи заявили, что, если результаты будут подтверждены в будущих исследованиях, они могут привести к идентификации у живых пациентов биомаркеров и клинических особенностей, связанных с эти молекулярные подтипы и более ранняя диагностика и вмешательство.

Наша систематическая идентификация и характеристика устойчивых молекулярных подтипов AD выявляют множество новых сигнальных путей, нарушенных регуляцией при AD, и определяют новые мишени. Эти результаты закладывают основу для определения более эффективных биомаркеров для раннего прогнозирования БА, изучения причинных механизмов БА, разработки терапевтических средств следующего поколения для БА и разработки более эффективных и целенаправленных клинических испытаний, что в конечном итоге приведет к точной медицине БА. Остающиеся проблемы для будущих исследований включают воспроизведение результатов в более крупных когортах, валидацию конкретных подтипов мишеней и механизмов, идентификацию периферических биомаркеров и клинических признаков, связанных с этими молекулярными подтипами ».

Д-р. Бин Чжан, доктор философии, директор Центра моделирования трансформирующих заболеваний и профессор генетики и геномных наук Медицинской школы Икана

Исследование подтипов болезни Альцгеймера проводится при поддержке Национального института старения (NIA) NIH и является частью программы по обнаружению и доклинической валидации Партнерства по ускоренным лекарствам – болезни Альцгеймера (AMP-AD). Это государственно-частное партнерство направлено на сокращение времени между открытием потенциальных мишеней для лекарств и разработкой новых лекарств для лечения и профилактики болезни Альцгеймера.

Источник:

Mount Sinai Health System

Ссылка на журнал:

Neff, RA, et др. (2021) Молекулярное определение подтипов болезни Альцгеймера с использованием данных секвенирования РНК позволяет выявить новые механизмы и мишени. Достижения науки. doi.org/10.1126/sciadv.abb5398.

Source link