Исследователи из клиники Мэйо объединили результаты функционального теста, измеряющего влияние унаследованных вариантов в гене рака груди и яичников BRCA2, с клинической информацией, полученной от женщин, прошедших генетическое тестирование, для определения клинической значимости многих вариантов BRCA2 с неопределенной значимостью ( ВУС). Результаты были опубликованы сегодня в исследовании, опубликованном в Американском журнале генетики человека .
«В гене BRCA2 содержится 4565 различных VUS, перечисленных в базе данных клинических вариантов Национального института здоровья (NIH)», – говорит Фергус Коуч, доктор философии, исследователь рака груди в клинике Майо. В базе данных перечислены варианты, представленные лабораториями генетического тестирования и исследовательскими группами.
Д-р. Коуч говорит, что 4565 вариантов составляют около 50% всех зарегистрированных вариантов BRCA2 в базе данных NIH. Он говорит, что у многих тысяч людей, протестированных по всему миру, есть эти варианты, но у них нет возможности узнать клиническое значение своих конкретных вариантов. И их врачи не имеют возможности использовать эту информацию для выбора методов профилактики рака груди или яичников или для выбора целевых подходов к лечению опухолей с изменениями BRCA2.
Текущий метод определения клинической значимости вариантов BRCA2 с неопределенной значимостью основан на серии правил Американского колледжа медицинской генетики и геномики ACMG / AMP, которые используют генетическую информацию о вариантах и информацию, полученную от пациентов и пациентов. «семьи».
Д-р. Фергус Коуч, научный сотрудник клиники Мэйо
Д-р. Коуч и его команда использовали функциональный тест, чтобы определить влияние многих VUS на активность восстановления повреждений ДНК BRCA2. Сначала они показали, что функциональный тест позволяет четко различать известные патогенные вызывающие рак варианты и известные доброкачественные варианты BRCA2, которые не повышают риск рака. Затем они применили тест к VUS и объединили результаты с другой информацией, основанной на правилах ACMG / AMP.
«Мы обнаружили, что 86% изученных нами ВУС были переклассифицированы как доброкачественные или патогенные, что является большим шагом вперед по сравнению с 10% или около того миссенс-вариантами в ДНК-связывающем домене, которые были ранее классифицированы», – говорит д-р. Диван. «Это первый случай, когда функциональный тест был объединен таким образом с информацией ACMG / AMP, и результаты показывают, что это очень эффективно».
Д-р. Коуч говорит, что результаты окажут положительное влияние на уход за пациентами, поскольку пациенты будут знать, являются ли ВУЗИ рака груди доброкачественными или патогенными.
«Пациенты с доброкачественным ВУЗИ будут теперь оцениваться на основе их личного и семейного анамнеза рака груди и яичников, а не на основании результатов генетического тестирования», – говорит доктор Коуч. «И пациенты, которые классифицируются как имеющие патогенные варианты, смогут получить пользу от более частого скрининга рака или профилактической мастэктомии, чтобы снизить риск развития рака груди»
.
Результаты также означают, что женщины с раком яичников теперь могут знать, подходят ли они для целевой терапии ингибиторами PARP.
Источник:
Ссылка на журнал:
Ричардсон, М.Е., и др. (2021) Сильные функциональные данные о патогенности или нейтральности классифицируют варианты ДНК-связывающего домена BRCA2 с неопределенной значимостью. Американский журнал генетики человека. doi.org/10.1016/j.ajhg.2021.02.005.
Диэнай