Исследователь Габриэла Дебеса, член исследовательской группы Simbiosis, возглавляемой Андресом Мойей из Фонда содействия здоровью и биомедицинским исследованиям региона Валенсия (Fisabio), изучала взаимосвязь кишечной микробиоты с раком толстой кишки у пациентов с Синдром Линча (наследственное заболевание, предрасполагающее к развитию рака) с использованием образцов тканей в формалине и консервированных в парафине.

Основная цель состояла в том, чтобы выяснить, возможно ли получить информацию о микробиоме на основе образцов, сохраненных таким образом. Это было изучено на образцах пациентов с синдромом Линча, у которых развился рак толстой кишки, и было сравнено, есть ли различия между последовательностями бактериальной ДНК слизистой кишечника, а также опухолями.

По словам Габриэлы Дебеса, первой подписавшейся, которая получила преддокторский грант от Испанской ассоциации против рака (AECC) в Валенсии, «было показано, что в опухолевых тканях больше присутствуют некоторые группы бактерий. ассоциированных с опухолями по сравнению с нормальной слизистой, например Fusobacterium nucleatum Bacteroides fragilis и Campylobacter. "

Эти результаты уже были получены ранее на образцах свежих тканей, но новой особенностью этого исследования было то, что оно извлекает эту информацию из старых тканей, сохраненных в формалине и парафине, которые хранились в IBSP-CV, Биобанке для Биомедицинские исследования и общественное здравоохранение в Comunitat Valenciana, которые являются частью Валенсийской сети биобанков.

В исследованиях этого типа обычно используются образцы свежих или замороженных тканей, что требует немедленного предоставления образцов или зависит от сложной инфраструктуры замораживания. Однако это исследование подтвердило предыдущие исследования, в которых анализировались блоки несвежей ткани.

Андрес Мойя, главный исследователь проекта, объяснил, что «это важное событие, потому что существует огромное количество сохраненных образцов, которые доступны в больницах и биобанках. Как правило, образцы берутся после операции из удаленной области, чтобы быть сохраняются в парафиновых блоках. Преимущество этого средства консервации заключается в том, что он не требует особых условий хранения и служит в течение многих лет »

Однако такой вид консервации образцов сопряжен с некоторыми трудностями. При изучении рака все большее значение приобретает геномная информация. Этот метод не так эффективен для получения этой информации, поскольку он повреждает как ДНК человека, так и ДНК бактерий, которая используется для анализа микробиома.

Несмотря на эти трудности, мы получили результаты, основанные на предыдущих исследованиях, проведенных со свежей тканью, где ДНК находится в оптимальных условиях для ее секвенирования ».

Висенте Перес-Брокаль, исследователь и первый подписавший исследование

Новые горизонты

Этот метод предлагает новые возможности, поскольку он не ограничивает образцы свежими доступными тканями, но можно использовать гораздо больше хранимых образцов. Основное приложение будет иметь возможность проводить ретроспективный анализ микробиома в наших образцах, сохраненных в парафине, в качестве альтернативы, когда свежая ткань недоступна для лечения колоректального рака и других патологий.

Доктор Антонио Лломбарт, главный исследователь группы клинической и молекулярной онкологии Fisabio и президент Технического комитета AECC Валенсии, объяснил, что «Это исследование является очень важным шагом для облегчения исследования того, как кишечная микробиота влияет на развитие кишечной микробиоты. рак толстой кишки у людей с синдромом Линча. Это позволит располагать информацией, чтобы иметь возможность разрабатывать новые, более эффективные методы ранней диагностики и профилактики, что очень важно при лечении этого типа рака, который очень распространен »

Кроме того, доктор Лломбарт, руководитель службы медицинской онкологии в больнице Арнау де Виланова, добавил, что «важно продолжать борьбу с колоректальным раком, от которого ежегодно страдают более 38 790 новых пациентов в Испании и стране. приводит к гибели более 15 770 человек »

Для исследования было использовано 98 образцов (по одному из опухолевых тканей и по одному из здоровой слизистой для каждого человека) от пациентов с диагнозом Синдром Линча, которые подвергались хирургическому лечению в период с 1996 по 2017 год. Образцы принадлежали 21 женщине и 28 мужчины в возрасте от 33 до 87 лет.