В 5-летнем исследовательском проекте участвуют 14 организаций из семи стран ЕС, и он финансируется ЕС на сумму 15 млн евро.

Лаборатория геномных данных, возглавляемая исследователем ICREA Фрэн Супек, проанализирует эволюцию опухолей яичников для разработки компьютерных моделей для прогнозирования устойчивости к лечению.

ЕС выделил 15 миллионов евро на пятилетний проект, направленный на улучшение индивидуального лечения рака яичников. В международном проекте DECIDER участвуют партнеры из 14 организаций из семи стран ЕС.

В Европе более 40000 женщин ежегодно умирают от рака яичников. Помимо хирургического вмешательства, большинство пациентов получают химиотерапию на основе платины. К сожалению, эффект химиотерапии часто уменьшается с циклами лечения, и в настоящее время доступно мало эффективных методов лечения для пациентов, у которых развивается устойчивость к препаратам на основе платины.

Проект стартует в феврале и предусматривает разработку диагностических инструментов для более раннего и более надежного выявления пациентов, не отвечающих на текущее лечение. На основе данных, собранных с опухолями, проект также направлен на поиск эффективных комбинированных методов лечения.

«Уникальность этого проекта, помимо многопрофильности и исключительного качества партнеров, заключается в том, что мы будем работать с несколькими образцами одних и тех же опухолей, взятыми в разные моменты времени. Мы будем изучать эволюцию опухоли, и наша главная цель – уметь предвидеть генетические изменения рака, которые приводят к резистентности к лечению », – говорит Фран Супек, руководитель лаборатории анализа геномных данных в IRB Barcelona.

Рак – одна из основных причин смертности в мире, и по мере старения населения заболеваемость раком будет только расти. Любые новые инструменты, которые сделают возможным более эффективное и целенаправленное лечение рака в будущем, не только уменьшат количество человеческих страданий, но и уменьшат нагрузку на здравоохранение »

Сампса Хаутаниеми, профессор и координатор проекта DECIDER, Университет Хельсинки

Искусственный интеллект для интеграции и визуализации информации о пациентах для врачей

В рамках проекта реакция пациента на лечение прогнозируется методами, в которых используются, среди прочего, гистопатологические и геномные данные пациента. Геномные изменения и отклонения в функциях генов используются для поиска эффективных, индивидуализированных методов лечения.

В лаборатории Genome Data Science 3-4 исследователя будут работать над разработкой вычислительных моделей, которые предсказывают эволюцию каждой конкретной опухоли и которые будут стремиться давать рекомендации по лечению на основе генетического профиля. Группа объединит экспериментальные подходы, основанные на редактировании генов, и вычислительные подходы, основанные на машинном обучении, чтобы понять механизмы устойчивости к лекарствам и радиации.

«Опухоли часто имеют дефектные механизмы восстановления своей ДНК, что ускоряет их эволюцию, но потенциально также приводит к уязвимости к лекарствам или лекарственной устойчивости. Если мы поймем механизмы, лежащие в основе резистентности, путем секвенирования опухоли мы сможем предсказать, действительно ли она в будущем легко сможет обрести устойчивость к определенному препарату. Это приведет к пониманию того, какие другие методы лечения будут более эффективными для этой конкретной опухоли, замедлить ее развитие и в конечном итоге улучшить результаты для здоровья », – объясняет Супек

.

Важной частью проекта будет сотрудничество с малыми и средними предприятиями (МСП) в разработке, производстве и регистрации диагностических наборов, производстве тестов на лекарственную чувствительность на основе образцов опухолей, разработке диагностики на основе изображений. цифровых образцов, а также разработка методов псевдонимизации и анонимизации данных, необходимых для управления конфиденциальными данными пациентов в целях защиты конфиденциальности. Организации пациентов играют важную консультативную роль в этом проекте.

Исследователи-правоведы обращаются к этическим и правовым вопросам

В дополнение к медицинским исследованиям, проект также включает юридический рабочий пакет, который затрагивает этические и правовые аспекты проекта. Кроме того, исследователи-правоведы также изучат, есть ли несоответствия между системой регулирования фармацевтики и другим соответствующим законодательством.