Исследователи из Biolinker, биотехнологического стартапа, базирующегося в Сан-Паулу, Бразилия, разрабатывают недорогой высокоэффективный диагностический тест COVID-19, используя только входные данные из местных источников.
Биолинкер инкубируется в Центре инноваций, предпринимательства и технологий Университета Сан-Паулу (CIETEC), совместно управляемом Университетом Сан-Паулу (USP) и Институтом ядерных и энергетических исследований (IPEN).
Этот проект был одним из первых, которые были выбраны в ходе конкурса заявок, выпущенных Программой инновационных исследований в области малого бизнеса (PIPE) FAPESP в партнерстве с FINEP, бразильским агентством по инновациям при правительстве, для ускоренного финансирования продуктов и услуг. или процессы, разработанные техническими стартапами и малыми предприятиями в штате Сан-Паулу для борьбы с COVID-19.
В течение нескольких месяцев мы планируем завершить разработку стандартизированного набора для обнаружения антител, циркулирующих в IgG, в сыворотке крови, вырабатываемой на более поздней стадии заболевания. Используемый метод – ELISA [enzyme-linked immunosorbent assay]. "
Мона дас Невес Оливейра, главный исследователь проекта и основатель фирмы, Исследовательский фонд Сан-Паулу – FAPESP Innovative R & D
В проекте будет использована технология бесклеточного синтеза белка, разработанная фирмой за последние два года, для ускорения и оптимизации процессов производства белка на основе системы транскрипции и трансляции in vitro. Исследователи использовали эту систему для разработки тестируемого белка.
«Испытания проходят очень хорошо», – сказала Оливейра. «Мы произвели белок и теперь очищаем его, чтобы избежать ложных срабатываний и ложных отрицательных результатов».
Группа также производит белки традиционными методами. «Мы сравним результаты, чтобы увидеть, какая производственная система обладает наилучшей антигенностью», – сказала Оливейра. Обнаружение антител
Обнаружение IgG в образцах крови пациентов будет осуществляться с использованием антигенов из белка нуклеокапсида, антигенной фракции белка шипа, используемого SARS-CoV-2 для проникновения в клетки человека путем связывания с рецептором ACE-2 в клетке. мембраны.
Благодаря проекту, поддержанному FAPESP, исследователи смогли разработать и проверить аптамер – пептид, который связывается с молекулой-мишенью – с сильным сродством и специфичностью для постоянной фракции антител IgG.
«Мы планируем использовать этот аптамер, конъюгированный с биотином [which acts as a coenzyme in purine and carbohydrate metabolism]для обнаружения», – говорит Оливейра.
Тестовый набор будет дешевым, потому что аптамер и антигены дешевы в производстве бесклеточным методом. Кроме того, фирма уже имеет свои собственные плазмиды (молекулы ДНК, которые могут самореплицироваться) для экспрессии белка и хорошо налаженные производственные протоколы.
«Это будет очень доступный, быстрый тест, который можно использовать где угодно для целей эпидемиологического скрининга», – сказала Оливейра. «Ведутся переговоры с компаниями, заинтересованными в массовом производстве тестового набора после его калибровки и утверждения для общего использования».
Эстер Сабино, профессор и исследователь Института тропической медицины Университета Сан-Паулу (IMT-USP), сотрудничает с проектом. Сабино руководил секвенированием SARS-CoV-2 в Бразилии.
Источник:
Исследовательский фонд Сан-Паулу