Команда гастроэнтерологов в больнице им. Анри-Мондора AP-HP и университете Paris-Est Créteil, возглавляемая профессором Ираджем Собхани, вместе с командами из Inserm и Institut Pasteur, Отдел молекулярного микробного патогенеза Института Пастера (U1202), возглавляемые профессором Филиппом Сансонетти, – заведующая кафедрой микробиологии и инфекционных заболеваний в Коллеж де Франс, продемонстрировала, что дисбаланс в микробиоте кишечника, также известной как «дисбиоз», способствует возникновению колоректального рака. Команды, действующие как группа «Oncomix» с апреля 2016 года, продемонстрировали, что пересадка фекальной флоры от пациентов с раком толстой кишки мышам вызывала повреждения и эпигенетические изменения, характерные для развития злокачественной опухоли.

Пилотное исследование, финансируемое Французским национальным институтом рака и продвигаемое Парижской сетью государственных больниц (AP-HP) в рамках госпитальной программы клинических исследований рака (PHRC-K), привело к разработке -инвазивный анализ крови, который идентифицирует эпигенетическое явление, связанное с дисбиозом. Тест был подтвержден на 1000 человек. Эти результаты были опубликованы в журнале Труды Национальной академии наук (PNAS) 11 ноября 2019 года.

Спорадический колоректальный рак может развиться у пациентов без каких-либо известных факторов риска. Это происходит в результате сложных взаимодействий между людьми и их средой. Растущая частота этого состояния отражает негативные изменения в окружающей среде, которые могут вызвать изменения в генетической и эпигенетической ДНК клеток-хозяев, способствуя тем самым возникновению спорадического колоректального рака.

В нескольких исследованиях исследована роль микробиоты как медиатора этих взаимодействий. Команда в отделе гастроэнтерологии в больнице им. Анри-Мондора AP-HP и Университете Парижа-Эст-Кретей вместе с командой, состоящей из сотрудников Inserm и Institut Pasteur, Отдел молекулярного микробного патогенеза Institut Pasteur (U1202) и кафедры микробиологии и инфекционных заболеваний. в Коллеж де Франс продемонстрировали на мышах, что эпигенетический механизм, запускаемый некоторыми бактериями в микробиоте, способствует возникновению или развитию спорадического колоректального рака. Впоследствии они подтвердили свои выводы на людях.

136 мышей в исследовании трансплантировали либо со свежим стулом от девяти пациентов со спорадическим колоректальным раком, либо со свежим стулом от девяти пациентов без расстройств толстой кишки. Процедура проводилась в больнице им. Анри-Мондора AP-HP. Колоны мышей обследовали через 7 и 14 недель после пересадки фекальной микробиоты человека. В частности, команды исследовали количество и развитие аберрантных очагов крипты (или АКФ, тип предракового поражения), микробный профиль и повреждение ДНК толстой кишки. Они также учитывали потребление пищи животными, вес и показатели крови.

Связь между фекальным дисбиозом (дисбаланс в составе кишечных бактерий) и генетической и эпигенетической сигнатурой ДНК в тканях животных была выявлена ​​с помощью статистических тестов. У мышей, которые получили свежий стул от пациентов со спорадическим колоректальным раком, развились предраковые поражения, известные как аберрантные очаги крипты (ACF), без каких-либо существенных генетических изменений в толстой кишке, но у них было большее количество гиперметилированных генов – которые были в значительной степени связаны с заболеваемостью АКФ в слизистой оболочке толстой кишки.

После проверки связи между фекальным дисбиозом и аномалиями ДНК (метилированием) у пациентов со спорадическим колоректальным раком, которые принимали участие в фекальных трансплантатах, было проведено пилотное исследование на людях с целью разработки простого воспроизводимого анализа крови, который может быть использован для ранней диагностики колоректальных опухолей у бессимптомных пациентов. Предполагаемая валидация теста была выполнена на 1000 бессимптомных пациентов, которым должна была быть сделана колоноскопия. Чтобы идентифицировать вовлеченные бактерии, весь их бактериальный геном был секвенирован. Уровень гиперметилирования трех генов определяли как совокупный индекс метилирования (CMI). Пациенты были классифицированы в соответствии с их CMI (положительным или отрицательным). Анализ выявил положительный CMI в качестве прогностического фактора возникновения спорадического колоректального рака.

Это исследование показывает, что микробиота субъектов со спорадическим колоректальным раком вызывает предраковые поражения толстой кишки у животных посредством гиперметилирования небольшого числа генов. Следовательно, CMI и / или метилирующие бактерии могут быть использованы в качестве диагностических маркеров для этого типа рака. Эти первоначальные результаты должны быть оценены и подтверждены в клиническом исследовании.