Добыча «самых темных» частей генома в раковых клетках дает золото

Исследование показывает, как двойное ДНК-кодирование может помочь улучшить диагностику грибковых инфекций
        

Добыча богатой неизведанной территории с геномом или генетическим материалом раковой клетки принесла золото ученым принцессы Маргарет: новые белковые мишени для разработки лекарств против рака простаты.

Используя современные технологии секвенирования целого генома на образцах опухоли простаты, исследователи Онкологического центра принцессы Маргарет сосредоточили внимание на часто пропускаемых некодирующих областях генома: огромных участках ДНК, свободных от генов (то есть не кодируют белки), но, тем не менее, содержат важные регуляторные элементы, которые определяют, включены или выключены гены.

Ранее считавшиеся «мусорной» ДНК, некодирующие регионы, как когда-то думали, мало что могли предложить для лечения рака.

Но это никогда не отговаривало доктора Матье Люпьена, старшего научного сотрудника Онкологического центра принцессы Маргарет, посвятить свою исследовательскую программу изучению некодирующего генома.

Мы исследуем неизведанную территорию. Наша цель – победить рак в нашей жизни. Мы должны искать повсюду, включая «самые темные» части генома раковых клеток, чтобы найти это скрытое «золото» ».

Д-р. Матье Люпин, доцент кафедры медицинской биофизики Университета Торонто, чей слоган в лаборатории – «Расшифровка рака с помощью эпигенетики».

В своей последней статье, озаглавленной «Распределение цистрома, выявляется конвергенция соматических мутаций и вариантов риска на основных регуляторах транскрипции при первичных опухолях предстательной железы», опубликованной в Cancer Cell в четверг, 14 ноября 2019 г., д-р Люпин и команда из 21-го члена национальных и международных клиницистов, ученых, патологов и специалистов по вычислительной технике оценили роль более чем 270 000 мутаций, обнаруженных в первичных опухолях предстательной железы.

Они обнаружили, что они накапливаются в определенных некодирующих областях, связанных определенным набором белков, которые контролируют состояние включения / выключения генов. Ингибирование этих белков, которые доктор Люпин называет «маэстро клетки», блокирует рост клеток рака предстательной железы, показывая их ценность для разработки лекарств.

Это представляет новый подход, который использует богатую информацию от всех мутаций, обнаруженных в опухолях, как из кодирующих, так и некодирующих источников. Это позволяет нам расставлять приоритеты для целей терапии, объясняет он.

Представьте себе возможности, которые открывает некодирующий геном », – добавляет он.

Понимание некодирующего или темного генома является областью повышенного внимания ученых.

В 2003 году в рамках проекта «Геном человека» был картирован и секвенирован геном человека, состоящий из всех генов, необходимых для роста человека.

Было обнаружено, что около 21 000 кодирующих белок генов составляют около двух процентов всего нашего генома – план жизни или буклет с инструкциями по генетике человека.

И другие 98% генома – некодирующая (для белков) часть – какую роль он играет?

Ученые пришли к выводу, что среди этой некодирующей ДНК скрыты важные элементы, которые не только контролируют активность тысяч генов, но и играют важную роль во многих заболеваниях. Добыча в этой области может дать важные подсказки последовательности для потенциальных лекарств.

Геном человека невероятно сложен, говорит доктор Люпин. Он объясняет, что темная или еще не обнаруженная часть генома содержит миллионы генных переключателей, влияющих на все клетки нашего тела, в разные моменты нашей жизни.

«Теперь мы можем начать соединять эти генетические переключатели с развитием рака, чтобы получить более точное понимание того, как начинается болезнь и как мы можем ее лечить».

Точная медицина в настоящее время опирается на несколько сотен комбинаций биомаркеров и лекарств, и нам нужно расширить наш список биомаркеров и лекарств, если мы хотим выполнить обещание точной медицины, добавляет доктор Люпин.

«Включение некодирующего генома в наш анализ является скачком в правильном направлении для достижения нашей цели».

        

Источник:

Университетская сеть здравоохранения

      

Source link