Отзыв Эмили Хендерсон, бакалавр наук 29 июля 2020

Группа исследователей из Бразилии, Дании, Италии и Испании проанализировала 884 образца грибов рода Candida, собранных из 16 больниц, и обнаружила значительное количество кластеров в более чем одной больнице. Кластеры представляют собой группы грибковых изолятов с идентичными последовательностями ДНК. Открытие может указывать на наличие более вирулентных и устойчивых к лекарствам сортов.

Исследование, опубликованное в журнале Границы в клеточной и инфекционной микробиологии было поддержано Исследовательским фондом Сан-Паулу – FAPESP.

Грибы, такие как дрожжи рода Candida, являются частью кишечной микробиоты человека – бактерии, археи и другие микроорганизмы, которые живут в пищеварительном тракте. Они не вызывают проблем, когда организм хозяина здоров, но если дисбаланс возникает из-за хронического заболевания или терапевтических процедур, связанных с длительным пребыванием в больнице, они могут попасть в кровоток и вызвать тяжелые, потенциально смертельные инфекции.

Кандидемия является наиболее распространенной грибковой инфекцией кровотока у госпитализированных пациентов. В основном это происходит в отделениях интенсивной терапии (ICU) и у пациентов, которые получили трансплантации органов или лечения некоторых видов рака, таких как лейкемия.

Мы должны следить за возможными источниками инфекции даже более тщательно, чем обычно, в то время, когда так много критических пациентов с COVID-19 находятся в больнице. Многие остаются в реанимации в течение двух-трех недель и подвергаются воздействию антибиотиков, иммуномодуляторов, инвазивных медицинских процедур и / или диализа. "

Арнальдо Лопес Коломбо, профессор медицинского факультета Федерального университета Сан-Паулу (EPM-UNIFESP) и единственный бразильский соавтор исследования

Большинство инфекций Candida происходит, когда грибок прорывается через кишечный барьер и попадает в кровоток в результате тяжелой болезни и длительного пребывания в больнице. Однако некоторые инфекции связаны с нарушениями медицинских инструкций по гигиене рук и неосторожным обращением с пациентами, подвергающимися инвазивным медицинским процедурам.

«Эти факторы допускают горизонтальную передачу среди разных пациентов, что объясняет скопления инфекций, обнаруженных в некоторых больничных палатах, и реже скопления, обнаруживаемые в более чем одном учреждении», – сказал Коломбо.

В 884 образцах, проанализированных в 16 больницах, исследователи выявили 723 генотипа трех видов: Candida albicans (534 образца), C. parapsilosis (282) и C. tropicalis (68). Больница ЮНИФЕСП (больница Сан-Паулу), единственный представитель не только Бразилии, но и Латинской Америки в исследовании, не показала значительных отличий от больниц в развитых странах с точки зрения частоты образования кластеров.

Все больницы, участвующие в исследовании, имеют программы контроля инфекций в больницах, которые теоретически должны уменьшить количество перекрестных инфекций между пациентами. Однако было обнаружено, что 78 изолятов (11% от общего числа) являются кластерами, причем один и тот же генетический профиль поражает нескольких пациентов. Большинство из этих кластеров (45 или 57%) не охватывали более одной больницы, но небольшая доля от общего числа изолятов (52 или 7,2%) была связана с различными больницами (21 в одном городе и 31 в разных городах). .

Анализ

Анализ проводился Хесусом Гвинеей в Научно-исследовательском институте здоровья Грегорио Мараньона (UCM-IISGM) в Комплутенском университете в Мадриде.

Изоляты генотипировали с помощью видоспецифических микросателлитных маркеров, которые представляют собой повторяющиеся последовательности ДНК, обычно длиной несколько пар оснований. Этот метод не так точен, как секвенирование всего генома, но позволяет анализировать многие образцы по разумной цене и с достаточной точностью для дифференциации образцов.

В будущем исследователи будут выполнять секвенирование всего генома на группе изолятов, чтобы подтвердить генетическое сходство внутри кластеров и усовершенствовать методологию микросателлитных маркеров для генетических исследований Candida. Кроме того, они надеются определить, что делает штаммы, образующие кластеры, такими вирулентными, чтобы разработать более эффективные методы лечения.

«Мы обнаружили, что штаммы, участвующие в кластерных эпизодах, лучше продуцируют биопленку, внеклеточный матрикс, который связывается с поверхностями и защищает их от неблагоприятных условий, в данном случае от иммунной системы человека», – сказал Коломбо.