Согласно анализу, проведенному Университетом штата Вашингтон, усилия по секвенированию геномов животных в мире, как правило, сосредоточены на тех, которые больше всего напоминают людей, при этом работа проводится почти полностью на Глобальном Севере.

В статье, опубликованной в Proceedings of the National Academy of Sciences исследователи из WSU и Университета Бригама Янга предупреждают, что текущие усилия упускают из виду огромное разнообразие и возможности.

Анализ показал, что почти у 3300 видов животных были секвенированы и собраны геномы, процесс, который дает организационный контекст для ДНК организма. Хотя этот показатель растет, их количество невелико по сравнению с 1,66 миллионами видов животных в мире, а позвоночные животные составляют львиную долю нынешних последовательностей.

На их долю приходится 54% всех скоплений, несмотря на то, что они представляют лишь 3,9% видов животных. Напротив, беспозвоночные типа членистоногих, который включает насекомых и пауков, составляют только 34% текущих наборов данных, в то время как представляют 78,5% всех видов.

В условиях быстрого накопления геномных сборок мы хотим думать о том, на что мы направляем наши усилия. Она не распространяется равномерно по животному древу жизни, беспозвоночные по-прежнему очень недопредставлены, что имеет смысл, учитывая, что люди, похоже, больше заботятся о позвоночных, так называемой «харизматической мегафауне »

.

Скотт Хоталинг, ведущий научный сотрудник и научный сотрудник, получивший докторскую степень, Вашингтонский университет

Семейство Hominidae, в которое входят человекообразные обезьяны и люди, собрало наиболее последовательные данные генома, но геном человека не самый длинный: это название принадлежит австралийской двоякодышащей рыбе. Из всех геномных данных только пять групп членистоногих были хорошо представлены: пчелы, бабочки, комары, дрозофилы и муравьи – все они примечательны своей полезностью или проблемами, которые они создают для людей.

«Мы заинтересованы в себе, и это не обязательно плохо», – сказал Пол Франдсен, автор статьи и доцент BYU. «Но чтобы начать понимать экосистемы в целом, мы должны начать выборку большего количества разнообразных форм жизни, чтобы получить более четкую картину. Позвоночные животные являются важными компонентами экосистем, но, возможно, насекомые и многие другие мелкие существа, вероятно, играют еще более важную роль, потому что они у основания пищевой сети ".

Авторы, Хоталинг, Франдсен и доцент WSU Джоанна Келли, также отметили, что подавляющее большинство работ по генетическому секвенированию проводится в развитых странах, которые часто называют Глобальным Севером, потому что большинство из них находится в Северном полушарии. Больше всего производят три страны: США, Китай и Швейцария. Были даже определенные предрасположенности к разным регионам: в Северной Америке больше всего секвенировали млекопитающих и насекомых, в Европе – рыб, а в Азии – птиц.

В последние годы было объявлено о нескольких крупных усилиях по секвенированию генома, включая инициативу Earth BioGenome Initiative, которая поставила амбициозную цель секвенировать всю эукариотическую жизнь, включая животных, бактерии и одноклеточные организмы, в течение следующих 10 лет. .

Текущее количество примерно 3300 сборок генома животных по состоянию на июнь 2021 года является большим скачком за 25 лет с момента получения первой последовательности генома животного, аскариды Caenorhabditis elegans в 1998 году. Но авторы подсчитали, что при нынешних темпах роста примерно четыре сборки генома в день, цель секвенирования всей эукариотической жизни не будет достигнута до 3130 года.

Исследователи предполагают, что одним из способов стимулирования дополнительных работ в этой области было бы развитие инфраструктуры и привлечение большего числа исследователей из стран Глобального Юга, особенно в тропических регионах, где также существует большое разнообразие животных.

«Если мы хотим создать глобальную дисциплину, нам нужно привлечь людей со всего мира», – сказал Хоталинг. «Это просто базовая справедливость, и с чисто научной точки зрения люди, которые живут в районах, где проводится секвенирование видов, имеют много знаний об этих видах и экосистемах. Они могут внести большой вклад»