Исследователи раскрывают причину эпидемии холеры в Аргентине в 1990-х годах

Ученые Фраунгофера разрабатывают метод измерения биологического возраста человека

Эволюция эпидемических и эндемических штаммов бактерии, вызывающей холеру Vibrio cholerae в Аргентине, была подробно нанесена на карту исследователями из Института Велком Сэнгер, Лондонской школы гигиены и тропической медицины, Университета Кембриджа и INEI-ANLIS "Dr Carlos G. Malbrán", Аргентина. Команды использовали полногеномное секвенирование для изучения бактерий, циркулировавших во время вспышки холеры в стране в 1991–1998 годах.

Эти данные повлияли на политику здравоохранения в Аргентине, где национальная система эпиднадзора теперь использует полногеномное секвенирование, чтобы различать пандемические и непандемические линии V. cholerae бактерии. Исследование опубликовано в Nature Communications сегодня (1 октября).

Холера, вызванная штаммами V. cholerae в настоящее время поражает 47 стран мира и уносит жизни почти 100 000 человек в год. С 1800-х годов в мире произошло семь пандемий холеры, унесших миллионы смертей. Текущая пандемия, начавшаяся в 1960-х годах, вызвана единственной линией V. cholerae названный 7PET. В то время как Южная и Центральная Латинская Америка в значительной степени оправились от вспышек, начавшихся на Гаити в 2010 году, эта линия продолжает циркулировать по всему миру и является причиной крупнейшей в мире эпидемии холеры, продолжающейся в Йемене, где были инфицированы сотни тысяч человек.

В новом исследовании команда секвенировала геномы уникального набора исторических V. cholerae хранящиеся в INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán", национальной справочной лаборатории Аргентины. Повторно проанализировав прошлое, международная группа исследователей надеется лучше понять будущие паттерны болезней и обеспечить быстрое оповещение о новых интродукциях пандемических линий.

Используя филогенетический анализ, они подтвердили, что вспышка холеры в Аргентине в 1992 году была вызвана одним введением 7PET V. cholerae бактерии, первоначально завезенные в Перу. Затем за шесть лет эпидемии бактерии очень мало эволюционировали. Это отличалось от разнообразных, множественных эндемичных штаммов V. cholerae циркулирующих в то же время. Предыдущая работа группы показала, что, хотя эндемичные штаммы могут вызывать у людей заболевания, у них, похоже, нет потенциала для быстрого распространения и возникновения эпидемии.

Когда пандемический штамм 7PET попадает в Латинскую Америку из других мест, он может вызвать массовые эпидемии, подобные тем, которые наблюдались в Перу в 1990-х годах и на Гаити в 2010 году. Если мы хотим эффективно контролировать эпидемии холеры, жизненно важно, чтобы мы способен различать и понимать различия между местными, эндемичными V. cholerae которые сосуществуют вместе с 7PET во время эпидемии холеры. В нашем исследовании была изучена геномная эволюционная история этих двух типов вместе в одной стране в течение десятилетия, когда в этом регионе произошли крупные вспышки холеры »

Мэтью Дорман, первый автор исследования Института Велкома Сэнгера

Полученные данные были использованы органами общественного здравоохранения в Аргентине, где в настоящее время национальная система оповещения была изменена, чтобы различать пандемическую линию 7PET и местную V. cholerae с использованием полногеномного секвенирования.

Благодаря всеобъемлющей системе эпиднадзора и отчетности справочная лаборатория в Аргентине содержит снимок всей эпидемии. Это дало нам уникальную возможность понять детальную эволюцию V. cholerae бактерий в нашей стране. Мы сможем использовать эти данные и этот опыт для информирования о том, как мы отслеживаем и реагируем на любые будущие вспышки холеры – бактерии, вызывающие эпидемии, представляют совершенно иной риск, чем те, которые этого не делают; это простая информация, которая имеет решающее значение для борьбы с болезнями. Мы – первая в мире национальная система отчетности, использующая геномные данные для подобного мониторинга холеры »

Д-р Хосефина Кампос, старший автор INEI-ANLIS "Доктор Карлос Г. Мальбран", Буэнос-Айрес, Аргентина

Профессор Ник Томсон, старший автор из Института Велком Сэнгер и Лондонской школы гигиены и тропической медицины, сказал: «Подобные подробные исследования способствуют нашему растущему пониманию того, как холера распространяется по всему миру: доказательства для улучшения стратегий борьбы а также определить области для дальнейших исследований. Наша задача состоит в том, чтобы лучше понять, почему такая простая бактерия продолжает представлять такую ​​угрозу для здоровья человека, с этим исследованием мы стали немного ближе »

Источник:

Wellcome Trust Sanger Institute

Ссылка на журнал:

Дорман, MJ, et др. (2020) Геномика эпидемии холеры в Аргентине проливает свет на контрастную динамику эпидемического и эндемического холерного вибриона. Nature Communications. doi.org/10.1038/s41467-020-18647-7.

Source link