Исследователи точно определяют генетические вариации, ответственные за развитие ВЗК

Новое открытие с использованием грибов может привести к разработке эффективных радиозащитных препаратов

        

Исследователи из Детской больницы Филадельфии (CHOP) определили генетическую вариацию, ответственную за развитие воспалительного заболевания кишечника (IBD). Генетический путь, связанный с этим изменением, связан с другими иммунными нарушениями, предполагая, что механизм, который они идентифицировали, мог бы служить важной терапевтической мишенью. Результаты были опубликованы сегодня в Journal of Crohn's and Colitis .

Две основные формы ВЗК, болезнь Крона и язвенный колит, имеют важный генетический компонент. Было идентифицировано более 240 генетических областей, которые ассоциируются с ВЗК, больше, чем любое другое патологическое состояние, которое было изучено. Однако, поскольку у каждого генетического региона есть несколько маркеров, важно идентифицировать те, которые являются причинно-следственными.

Используя различные анализы и современные методы секвенирования, исследовательская группа стремилась охарактеризовать однонуклеотидный полиморфизм (SNP) rs1887428, который расположен в промоторной области гена JAK2. Белок, кодируемый этим геном, отвечает за контроль производства клеток крови. Мутации JAK2 были связаны с различными видами рака крови. Для лечения аутоиммунных расстройств и злокачественных новообразований было разработано несколько лекарств. Однако генетические и биологические маркеры необходимы для определения того, будут ли пациенты реагировать на них.

Мы выбрали этот SNP для углубленного изучения из-за его высокой вероятности изменения выражения JAK2. Модель, которую мы создали в этом исследовании, может помочь нам узнать больше о других причинных SNP, связанных с другими аутоиммунными заболеваниями. "

Кристофер Кардинал, доктор медицинских наук, ученый из Центра прикладной геномики при CHOP и первый автор исследования

Исследование идентифицировало белки, известные как факторы транскрипции, которые регулируют экспрессию генов, которые были связаны с этим конкретным SNP. В частности, два фактора транскрипции – RBPJ и CUX1 – могут распознавать последовательность ДНК, измененную SNP rs1887428. Кроме того, исследователи обнаружили, что хотя SNP оказывает очень скромное влияние на экспрессию JAK2, этот эффект усиливался другими белками в пути JAK2.

«Используя этот метод, мы считаем, что мы добавили важный инструмент в наш арсенал методов присвоения SNP-гену, что позволяет нам точно определять генетические мутации, вызывающие заболевания, которые ранее было трудно правильно распределить по риску», – сказал Хакон. Хаконарсон, доктор медицинских наук, директор Центра прикладной геномики при CHOP и старший автор статьи. «Это исследование, в частности, также предоставляет доказательства того, что препараты, нацеленные на JAK2, могут дать некоторую пользу тем пациентам, страдающим ВЗК, которые несут мутации, которые усиливают путь JAK2, хотя такие точные подходы должны быть подтверждены в клинических исследованиях».

        

Источник:

Детская больница Филадельфии

Ссылка на журнал:

Cardinale, CJ и др. (2020) Регуляция Янус-киназы 2 с помощью некодирующего одиночного нуклеотидного полиморфизма воспалительного заболевания кишечника. Журнал Крона и Колит. doi.org/10.1093/ecco-jcc/jjz213.

      

Source link