Майнинг 25 лет данных показывает новое понимание в предсказании возраста начала болезни Хантингтона

        

Исследователи из Университета Британской Колумбии (UBC) / Центра молекулярной медицины и терапии (CMMT) и Детской больницы Британской Колумбии изучили более 25 лет данных, чтобы выявить новые идеи в прогнозировании возраста возникновения болезни Гентингтона.

Это открытие может позволить нам предоставить семьям дополнительную информацию. Это может также потенциально улучшить управление заболеванием, предоставляя генетическим консультантам ценные данные в будущем ».

Ведущий автор Гален Райт, научный сотрудник медицинского факультета UBC, CMMT и BC Children's

Болезнь Гентингтона – это наследственное заболевание, которым страдает один из приблизительно 7000 канадцев. На каждого больного приходится от четырех до пяти человек, которые несут мутацию гена, которая вызывает заболевание, но еще не больны. Заболевание часто начинается в возрасте около 40 лет. Симптомы включают двигательные, когнитивные и психиатрические изменения.

Болезнь Гентингтона вызывается единственной мутацией в гене Хантингтина, где пациенты несут расширенный участок повторяющейся ДНК. В то время как длина этой мутации долгое время считалась лучшим показателем того, когда (и есть ли) у человека будут проявляться симптомы заболевания, исследователи UBC обнаружили генетический вариант, который также значительно влияет на возраст начала у пациентов.

Наше исследование показывает, что на возраст начала болезни Хантингтона влияет не только длина мутации расширения, но также последовательность ДНК, непосредственно примыкающая к этой повторяющейся последовательности. "S

Старший автор доктор Майкл Хейден, профессор медицинской генетики и почетный директор КММТ, который является частью медицинского факультета в UBC и расположен в BC Children's

Это ключевой вывод в новом исследовании, опубликованном сегодня в Американском журнале генетики человека . В то время как предыдущие исследования гена Хантингтина были сосредоточены на длине цепочки строительных блоков глютамина в ДНК гена, в этом исследовании рассматривались варианты последовательности ДНК, кодирующей эти строительные блоки глютамина, и взаимосвязь между этими вариантами и возрастом. начало болезни.

Последовательность ДНК, которая вызывает болезнь Хантингтона, в основном состоит из повторов трех букв ДНК, CAG, которые кодируют строительный блок белка, глютамин. Но исследователи UBC показали, что присутствие другого строительного блока глутамина, CAA, значительно влияет на заболевание. У людей, у которых последовательность CAA заменена последовательностью CAG, было обнаружено, что у пациентов с этим расстройством на десятилетия раньше, чем ожидалось, несмотря на то, что они содержат одинаковое количество аминокислот глютамина.

«Теперь мы знаем, что возраст начала болезни Хантингтона значительно зависит от длины непрерывной последовательности CAG», – сказал Хайден.

Длина непрерывной последовательности CAG также, по-видимому, способствует соматической нестабильности.

Исследователи провели скрининг образцов от пациентов в биобанке болезни Гентингтона UBC на предмет варианта в гене Хантингтина, чтобы выяснить возраст начала и вероятность того, что мутация будет расширяться, чтобы увеличить повторяемость в крови. Хайден основал этот банк – который в настоящее время содержит приблизительно 8 000 образцов – в 1986 году, чтобы провести такие исследования.

Команда Хейдена надеется отобрать дополнительные образцы ДНК для дальнейшего уточнения моделей прогнозирования возраста для людей из семей с болезнью Хантингтона с этим вариантом, а также посмотреть, как эти варианты выражают себя в ткани мозга.

Источник:

Университет Британской Колумбии

Журнал:

Hayden, M. и др. . (2019) Длина непрерывного CAG, независимо от размера полиглутамина, приводит к повышенной соматической нестабильности, ускоряя начало болезни Хантингтона. Американский журнал генетики человека. doi.org/10.1016/j.ajhg.2019.04.00

      

Source link