Новый метод отображает поверхностные белковые комплементы на большое количество отдельных экзосом

Новый метод отображает поверхностные белковые комплементы на большое количество отдельных экзосом
      

        

Растет потребность в диагностических маркерах для раннего выявления и прогнозирования заболевания. Экзосомы являются потенциальными биомаркерами для прогрессирования рака и нейродегенеративных заболеваний, но может быть трудно определить, из какой ткани поступает конкретная экзосома. Исследователи из Упсальского университета и дочерней компании Vesicode AB решили эту проблему, разработав метод, который отображает поверхностные белковые комплементы на большое количество отдельных экзосом.

Экзосомы высвобождаются из всех клеток организма. Они передают белковые и нуклеиновые кислоты между клетками как форму межклеточной коммуникации и представляют собой потенциальные циркулирующие биомаркеры для прогрессирования опухоли и метастазирования, а также для раннего выявления нейродегенеративного заболевания.

Чтобы использовать экзосомы в качестве биомаркеров заболеваний в различных тканях, жизненно важно различать их в соответствии с их поверхностными белковыми комплементами. Исследователи из Упсальского университета и Vesicode AB вместе с сотрудниками разработали метод, который может картировать поверхностные белковые комплементы на большом количестве отдельных экзосом.

Новый анализ, основанный на зависимом от близости штрих-кодировании (PBA), выявляет поверхностный белковый состав отдельных экзосом с использованием конъюгатов антитело-ДНК и секвенирования следующего поколения. Этот метод идентифицирует белки на отдельных экзосомах с использованием одноцепочечных кластеров ДНК с уникальной меткой микрометрового размера, полученных путем амплификации с вращающимся кругом.

«Эта технология принесет пользу не только исследователям, изучающим экзосомы, но и позволит обнаруживать биомаркеры с высокой пропускной способностью. Мы продолжим разработку и аттестацию технологии PBA и предоставим услуги исследователям, начиная с конца этого года. Мы считаем, что единый анализ экзосом позволит это сделать». захватывающий класс биомаркеров, чтобы полностью раскрыть свой потенциал », – говорит Ди Ву, исследователь и изобретатель технологии PBA и основатель Vesicode AB, коммерциализирующей технику.

Эта новая технология позволит проводить широкомасштабные скрининг биомаркеров при заболеваниях, дополняя панель методов для чувствительного и специфического обнаружения экзосом, которые мы ранее установили. "

Масуд Камали-Могаддам, один из руководителей группы в отделе молекулярных инструментов в Упсальском университете

        

Источник:

Ссылка на журнал:

У, Д. и др. . (2019) Профилирование поверхностных белков на отдельных экзосомах с использованием анализа бесконтактного штрих-кодирования. Nature Communications . doi.org/10.1038/s41467-019-11486-1.

      

  

            

          

Опубликовано в: Молекулярная и структурная биология

Метки: антитело, анализ, биомаркер, рак, ДНК, экзосома, экзосомы, метастазирование, нейродегенеративное заболевание, нуклеиновая кислота, белок, опухоль

            

      

Source link