Программа Партнерства по ускоряющим лекарственным средствам (AMP) для лечения болезни Паркинсона (PD) запустила портал данных, чтобы предоставлять де-идентифицированную информацию, собранную у 4298 пациентов с PD и здоровыми контролями, для исследователей, работающих над разработкой эффективных методов лечения этой болезни. Портал позволяет исследователям изучать сложные наборы данных и выполнять анализ всего генома в масштабах, ранее невозможных.

AMP PD – это государственно-частное партнерство между Национальными институтами здравоохранения, Управлением по контролю за продуктами и лекарствами США, с промышленностью (Celgene, GSK, Pfizer, Sanofi и Verily) и некоммерческим (Фонд Майкла Дж. Фокса для Исследовательская организация Паркинсона и управляется через Фонд Национального института здоровья (FNIH). Цель этого партнерства – преобразовать и ускорить разработку лекарств при БП, предоставляя экспертные знания и поддержку, необходимые для определения того, какие биомаркеры демонстрируют наибольший потенциал для прогнозирования БП и прогрессирования заболевания.

AMP PD – истинный пример того, что целое больше суммы его частей. Комбинация множества наборов данных может дать исследователям больше возможностей для анализа потенциальных биомаркеров для болезни Паркинсона. Это усилие следует за другими программами AMP, которые преследуют общую цель: изменить подход к изучению болезней ».

Вальтер Корошец, доктор медицинских наук, директор Национального института неврологических расстройств и инсульта (NINDS)

Портал знаний AMP PD содержит данные из образцов спинномозговой жидкости, РНК, плазмы и ДНК, ранее собранные в рамках программ, в том числе исследования Фонда Паркинсона (MJFF) и Национального института неврологических расстройств и инсульта (NINDS), проведенного BioFIND. Гарвардское исследование биомаркеров Бригама и Женской больницы и Массачусетской больницы общего профиля, Программа биомаркеров болезни Паркинсона NINDS и Инициатива Маркеров прогрессирования болезни Паркинсона от MJFF. Кроме того, AMP PD предоставляет платформу, которая может включать дополнительные источники данных и новые типы данных, включая протеомику, проект, который уже запланирован.

«Одна важная часть этой платформы заключается в том, что, помимо предоставления места для хранения сложных данных, мы также предоставляем инструменты для анализа этих данных в самой платформе», – сказала Дебра Бабкок, доктор медицинских наук, доктор философии. программный директор NINDS и сопредседатель Руководящего комитета AMP PD. «Таким образом, мы приводим ученых к данным, которые расширят возможности для сотрудничества».

В течение последних 18 месяцев научные группы AMP PD работали над тем, чтобы данные, добавленные в портал, были точными и соответствовали друг другу. Этот важный шаг, называемый гармонизацией данных, позволяет сравнивать информацию, собранную из разных программ, а также предоставляет передовые методы интеграции новых данных, предоставленных сообществом, в платформу. Одной из уникальных особенностей этих данных является то, что они являются продольными – это позволит исследователям анализировать данные на протяжении всей жизни человека или течение заболевания.

Благодаря единому соглашению об использовании данных, исследователи могут сегодня подать заявку на доступ к порталу знаний и взаимодействовать со всем набором данных, приведенным здесь.

«Модель AMP предоставила уникальную платформу для объединения разнообразных групп пациентов, достижений в области технологий и научных знаний для изучения болезни Паркинсона в таких масштабах, которые ранее не были предприняты», – сказал Дэвид Уолли, старший вице-президент исследовательского партнерства ФНИХ. «С помощью портала знаний AMP PD мы помогаем научному сообществу во всем мире ускорить открытия, которые, как мы надеемся, в конечном итоге помогут пациентам с болезнью Паркинсона и их семьям».