De novo варианты (DNV), генетические мутации, которые ранее не были идентифицированы в семейном анамнезе одного из двух предполагаемых родителей, могут вызывать заболевание у любых детей, которые у них есть. Если вызывающий заболевание DNV присутствует у одного из родителей, риск передачи его ребенку может достигать 50%, и возможность идентифицировать здоровые эмбрионы для переноса, чтобы избежать пораженной беременности, явно является высоким приоритетом.

Для достижения этой цели идентификация группы генов, унаследованных от одного родителя (гаплотип), которая связана с мутацией, необходима для переноса только здоровых эмбрионов. До сих пор это был сложный процесс, часто требующий множественной биопсии эмбриона, что само по себе сопряжено с риском. Но группа бельгийских исследователей разработала новый универсальный метод с использованием ДНК от родителей пострадавшего предполагаемого родителя (бабушки и дедушки эмбриона / ребенка). Они представят свои выводы на ежегодной конференции Европейского общества генетиков человека сегодня (вторник).

Д-р Эфтихия Димитриаду, руководитель отделения репродуктивной генетики Центра генетики человека, Университетская больница Левена, Левен, Бельгия, и ее коллеги набрали 22 пары, у одного из партнеров которых была мутация DNV, вызывающая менделевское расстройство. Менделевское расстройство обычно, но не всегда, вызвано изменениями в одном гене. По словам д-ра Димитриаду, нынешняя практика отбора эмбрионов для предимплантационного генетического тестирования (PGT) для таких пар сложна. «Это включает в себя нацеливание на конкретный ген, и поэтому важная общегеномная информация отсутствует».

Исследователи решили попытаться упростить процесс с помощью секвенирования с длинным считыванием (LRS), метода, который может считывать последовательность очень длинных фрагментов ДНК. Основным преимуществом LRS является то, что он намного точнее обнаруживает варианты числа копий (CNV), то есть делеции или дупликации фрагментов ДНК, и однонуклеотидные варианты (SNV), то есть изменения в последовательности одной молекулы ДНК, особенно в регионах, где повторяются одни и те же участки ДНК.

Определение существования таких вариантов имеет важное значение для диагностики или прогнозирования генетического заболевания. В частности, LRS позволяет раздельное секвенирование двух копий области или фрагмента ДНК (у предполагаемого родителя, несущего мутацию de novo ), по одной унаследованной от каждого родителя («дедушки и бабушки» эмбриона).

Это позволяет нам определить, находится ли вызывающая заболевание мутация на материнской или отцовской копии пораженной хромосомы у пациентов с DNV. Впоследствии мы можем провести всесторонний анализ эмбрионов в одном тесте и перенести те, которые не затронуты – и все это в рамках единого рабочего процесса. Однако это лучший сценарий. В тех редких случаях, когда у двух бабушек и дедушек одинаковые профили SNP, интерпретация оказывается еще более сложной. "

Д-р Эфтихия Димитриаду, руководитель отделения репродуктивной генетики, Центр генетики человека, Университетская больница Левена

В дополнение к обнаружению доминантно наследуемого заболевания, когда одной копии связанной с заболеванием мутации достаточно, чтобы вызвать заболевание, тест также может обнаруживать эмбрионы с аномальным числом хромосом для всего генома (анеуплоидии). Однако всеобъемлющий тест не означает, что можно обнаружить каждую генетическую аномалию.

Новый тест начал применяться в клинической практике только недавно, но из 23 циклов ЭКО / ПГТ, которые уже прошли, 15 эмбрионов не имели мутаций, не имели обнаруживаемых геномных генетических аномалий и были адекватного качества для переноса. В результате произошло шесть беременностей и родилось трое детей.

"Поскольку дети, рожденные с генетическим заболеванием, часто имеют тяжелые физические проявления, понятно, что их родители часто обеспокоены риском развития у ребенка наследственного заболевания, например, нейрофиброматоза ¹ или Синдром Альпорта ² . Для родителей открытие того, что один из них болен болезнью, уже наложило огромное эмоциональное бремя, и поэтому мы гордимся тем, что смогли принести новую надежду пострадавшим семьям. Наша работа является хорошим примером того, чего может достичь многопрофильная академическая группа, ориентированная на пациента », – говорит д-р Димитриаду.

«Однако на горизонте маячит облако. Новые, инновационные, тесты, такие как наши,« самодельные »в нашей больнице, могут быть запрещены Постановлением ЕС об устройствах для лабораторных исследований (IVDR) в связи с вступлением в силу. в мае 2022 г. IVDR ставит под угрозу разработку и использование собственных лабораторных тестов, запрещая их использование, если на рынке имеется коммерчески производимый «эквивалент». Но часто тест, который считается эквивалентным, не является достаточно точным. Запрещение использования тестов на редкие заболевания или тех, которые выполняются нечасто и, следовательно, не имеют большого значения для коммерческого сектора, ставит под угрозу возможности лабораторий для разработки новых специализированных диагностических тестов, которые необходимы, если мы хотим и дальше наилучшим образом обслуживать людей. интересы пациентов ", – заключает она.

Председатель конференции ESHG, профессор Александр Реймон, директор Центра интегративной геномики, Университет Лозанны, Лозанна, Швейцария, сказал: «Репродуктивная медицина началась с цели позволить бесплодным парам иметь детей. Прогресс был быстро за 43 года с момента рождения первого ребенка ЭКО, что привело ко многим достижениям, в том числе в пренатальной диагностике. Теперь, благодаря долгосрочному секвенированию, он может сделать еще один шаг вперед и помочь семьям, находящимся в "генетически подверженном риску", в их желании иметь незатронутое потомство ".