Поставка продовольствия в мире станет более безопасной, поскольку пищевая промышленность переходит на секвенирование всего генома с высоким разрешением, при котором анализируется полная ДНК определенного организма одновременно. Этот шаг, чтобы сделать последовательность вездесущим, приведет к неизменно надежному обнаружению сальмонелл.

Статья, опубликованная в журнале «Границы в микробиологии» в соавторстве с исследователями из Корнельского университета и Глобального центра по безопасности пищевых продуктов Марс (GFSC), Пекин, – освещает достижения.

Сальмонелла является пищевым патогеном, оказывающим наибольшее влияние на здоровье населения и экономику мира. Это одна из основных причин диареи во всем мире. Сальмонелла может быть легкой или привести к смерти, поскольку ее тяжесть зависит от серотипов сальмонеллы [distinct variations] – и это то, что мы пытаемся выяснить. "

Мартин Видманн, профессор по безопасности пищевых продуктов и преподаватель Корнельского института пищевых систем

В статье описывается, как пищевой промышленности во всем мире следует чаще использовать молекулярные методы для подтипирования и характеристики сальмонелл. В статье сравниваются более старые методы подтипирования – некоторые практики, восходящие к 1930-м годам – ​​с более новым секвенированием всего генома, методом, который может анализировать более широкий и более полный набор генома.

С помощью этой методики ученые могут более точно идентифицировать конкретный штамм сальмонеллы и определить происхождение и путь возникновения заболевания, сказал Видманн.

Например, в начале июля Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США и федеральные центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) использовали эту технику, поскольку начали расследовать подозреваемую связь сальмонеллы между лакомствами с собачьими ушами и людьми – из-за люди, занимающиеся угощением. В то время в 13 штатах было 45 случаев сальмонеллы, по данным CDC, госпитализировано 12 человек.

«Секвенирование всего генома быстро становится методом выбора для подтипирования сальмонеллы», – сказал микробиолог Силин Танг, ведущий автор статьи и старший научный сотрудник в Глобальном центре безопасности пищевых продуктов Mars. «Продукты питания часто попадают к потребителю через все более сложные цепочки поставок, создавая множество возможностей, где безопасность продуктов питания может быть поставлена ​​под угрозу. Недавние случаи подчеркивают необходимость усиления мер контроля сальмонеллы в пищевой промышленности, включая быстрое и точное отслеживание источников загрязнения с помощью соответствующих инструментов подтипирования. «

Тан сказал, что у пищевой промышленности есть возможность создать талантливую экспертную сеть в области биоинформатики – использования программных средств для понимания биологических данных – для использования всего потенциала технологий секвенирования всего генома.

Далее, сказал Видман, эта статья представляет собой перевод академического анализа в полезное промышленное приложение. «Это поможет промышленности внедрить более эффективные способы активного устранения осложнений и сложности сальмонеллы», – сказал он.