Исследования подчеркивают проблемы в использовании данных Ct для руководства клиническим планированием COVID-19

Исследования подчеркивают проблемы в использовании данных Ct для руководства клиническим планированием COVID-19

Тяжелый острый респираторный синдром, вызванный коронавирусом 2 (SARS-CoV-2), связан с высоким глобальным риском заболеваемости и смертности среди пациентов с сопутствующими заболеваниями. У пациентов с COVID-19 наиболее распространенными сопутствующими заболеваниями были гипертония, ожирение и сахарный диабет

Большинство пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, имеют отрицательный результат через 14 дней после первоначального заражения, тогда как некоторые пациенты могут оставаться положительными по РНК в течение нескольких месяцев. Недавнее появление повторных инфекций, случаев прорыва вакцины и вариантов ЛОС, вызывающих озабоченность, таких как вариант Дельта, который, как было замечено, повышается до более высоких титров вируса, подчеркивает клиническую необходимость интерпретировать положительные результаты SARS-CoV-2 от тот же человек.

Текущий золотой стандарт теста на SARS-CoV-2 – это клинический диагностический тест ОТ-ПЦР, однако этот тест не является количественным. Значения Ct, полученные в результате теста RT-PCR, обратно пропорциональны количеству РНК, присутствующей в образце, но на них влияют характеристики образца, пациента и диагностического теста.

В новом исследовании, в котором участвовали исследователи из различных институтов, описана естественная история тестирования SARS-CoV-2, которое включает значения Ct среди пациентов, у которых несколько раз давали положительный результат до появления ЛОС в списке вакцин. -из. Кроме того, авторы анализируют временную шкалу позитивности и клинических особенностей популяции пациентов с длительной позитивной реакцией на SARS-CoV-2.

Препринтная версия этого исследования, которая еще не прошла экспертную оценку, доступна на сервере препринтов medRxiv *.

Исследования подчеркивают проблемы в использовании данных Ct для руководства клиническим планированием COVID-19

Диагностические характеристики пациентов с множественными положительными тестами на SARS-CoV-2

Из 207 пациентов, у которых было несколько положительных тестов в этом исследовании, которые не проявляли продолжительного положительного результата, 17 показали образцы перемежающейся положительности из-за наличия по крайней мере одного отрицательного теста между их первым и последним положительным тестом. Этот перемежающийся положительный результат наблюдался более чем в три раза чаще среди 57 пациентов, показавших длительный положительный результат в этом исследовании.

Значения Ct по результатам тестов RT-PCR обычно снижаются с течением времени, но у пациентов, участвовавших в этом исследовании, наблюдались различные темпы снижения. Из пациентов с длительным положительным результатом у 123 были доступны значения Ct, полученные в результате их первого и последнего положительных тестов.

Среди этих пациентов итоговые положительные тесты были в среднем на 9,8 циклов выше, чем в первый раз, когда они дали положительный результат, что указывает на то, что было обнаружено меньшее количество РНК. Однако у 11 из этих пациентов в последнем положительном тесте было обнаружено большее количество РНК, чем в первом.

В целом, окончательные положительные тесты варьировались от 22,5 циклов ниже до 31,8 циклов выше, причем окончательные положительные результаты тестирования были близки к пределу обнаружения (> 35) для 21 пациента. Данные первого и последнего теста были доступны для 36 пациентов, у которых были продолжительные положительные тесты. Окончательные положительные тесты были в среднем на 14 циклов выше, чем первые положительные тесты.

В отличие от пациентов без длительного положительного результата, не было пациентов с длительным положительным результатом, у которых значения Ct в терминальном тесте были ниже, чем у их первого положительного теста.

Из длительно положительных пациентов у 33 были положительные тесты, близкие к пределу обнаружения (> 35Ct), что соответствует снижению вирусной ДНК с течением времени. Однако после первого положительного теста к 40-му дню у 5 пациентов все еще наблюдались значения Ct <35, а у одного пациента были получены положительные результаты, показывающие значение Ct <35 109 дней после первоначального положительного теста.

Исследования подчеркивают проблемы в использовании данных Ct для руководства клиническим планированием COVID-19 3-го квартиля, серый цвет указывает на пациента с кратковременным положительным результатом. График для скрипки и прямоугольника показывает общее распределение дней между первым и последним положительным тестом. "Height =" 775 "src =" http://www.news-medical.net/image.axd?picture=2021%2f10%2fA12.jpg "title =" Сводка времени между первым и последним положительным тестом для пациентов с множественными положительными тестами. Ось Y показывает дни между первым и последним положительным тестом, отдельные точки указывают отдельных пациентов. Синий цвет указывает на пациента с длительным положительным результатом, определяемого при естественном изломе продолжительности> 3-го квартиля, серый цвет указывает на пациента с кратковременным положительным результатом. График в виде скрипки и прямоугольника показывает общее распределение дней между первым и последним положительным тестом. "Width =" 1009 ">

Резюме времени между первым и последним положительным тестом для пациентов с множественными положительными тестами. Ось Y показывает дни между первым и последним положительным тестом, отдельные точки указывают отдельных пациентов. Синий цвет указывает на пациента с длительным положительным результатом, определяемого при естественном изломе продолжительности> 3-го квартиля, серый цвет указывает на пациента с кратковременным положительным результатом. График для скрипки и коробки показывает общее распределение дней между первым и последним положительным тестом.

Последствия

Результаты 8% пациентов, показывающих перемежающуюся положительную реакцию с множественными положительными тестами на SARS-CoV-2 до устойчивой передачи ЛОС, предполагают, что качество образцов играет значительную роль в результатах Ct.

Интересно, что у пациента с длительным положительным результатом было в три раза больше шансов проявить перемежающийся положительный результат. Таким образом, периодические отрицательные результаты у некоторых пациентов могут быть связаны с терапевтическими вмешательствами, изменчивой динамикой выделения, среди других переменных, которые следует изучить в будущих исследованиях.

По мере того, как пандемия продолжает развиваться и ЛОС, способные к более высоким титрам и прорывные вакцины, такие как вариант Дельта, становятся все более распространенными, информация о продольном тестировании с вариабельностью значений КТ станет более доступной для более значительного числа пациентов.

В связи с появлением в обращении новых вариантов жизненно важно помнить о возможности выделения переменных на любой стадии инфекции и быть осторожными при интерпретации значений Ct как косвенных мер тяжести и инфекционности.

Крайне безотлагательно разработать и внедрить диагностические тесты, которые могут различать повторное заражение и длительное выделение, что даст представление об инфекционности и поможет на будущих этапах пандемии.

* Важное примечание

medRxiv публикует предварительные научные отчеты, которые не рецензируются и, следовательно, не должны рассматриваться как окончательные, руководящие клинической практикой / поведением, связанным со здоровьем, или рассматриваться как установленная информация.

Ссылки

Ссылка в журнале:

  • Продольное тестирование SARS-CoV-2 перемежается периодическим положительным результатом и переменными 3 темпами снижения порога цикла, Шон Э. Хокен, Субхашини А. Селлерс, Джейсон Р. Смедберг, Джереми Д. Уорд, Герберт К. Уинна, Уильям Фишер, Мелисса Б. Миллер, medRxiv, 2021.10.01. https://doi.org/10.1101/2021.10.01.21264373, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.10.01.21264373v1

Source link