Команда исследователей из Геттингенского университета разработала инновационную программу для моделирования программ разведения.
«Симулятор модульной программы разведения» (MoBPS) позволяет имитировать очень сложные программы разведения животных и растений и предназначен для помощи селекционерам в их повседневных решениях.
Кроме того, программа призвана стать краеугольным камнем для дальнейших исследований в области селекционных исследований в Геттингене. В дополнение к чисто экономическим критериям в селекции, исследовательская группа стремится к таким целям, как устойчивость, сохранение генетического разнообразия и улучшение благосостояния животных. Программное обеспечение было представлено в журнале G3 Genes, Genomes, Genetics.
Моделируя программы разведения, можно сделать выводы о генетических улучшениях. Фактически, потенциально проблемные вопросы, такие как инбридинг или неблагоприятные воздействия на здоровье животных, также могут быть выявлены на ранней стадии ».
Торстен Пок, Центр комплексных исследований в селекции, Геттингенский университет
Пок является основным разработчиком MoBPS. Программное обеспечение предоставляет возможности для реалистичного моделирования общих процессов в селекции, таких как отбор, размножение и сбор данных (например, информация ДНК, наблюдения за признаками). В то же время, он может моделировать миллионы спариваний животных с определенными характеристиками всего за несколько минут.
«От моделирования простых программ по разведению кукурузы до более пристального внимания к стабильности костей при разведении лошадей и до симулированного развития популяций благородных оленей в Баден-Вюртемберге за последние 200 лет все было сделано», – сказал Пок .
Следующая цель исследовательской группы – разработать дополнительный модуль для MoBPS, который может автоматически оптимизировать программы разведения с большим количеством переменных и с учетом заданных ограничений.
Источник:
Ссылка на журнал:
Пок, Т., и др. . (2020) MoBPS – Симулятор Модульной Программы Разведения. G3 Genes, Genome, Genetics . DOI. орг / 10. 1534 / g3. 120. 401193.