Первый обширный анализ белков у пациентов с острым лимфобластным лейкозом

        

Наиболее распространенной формой детского рака является острый лимфобластный лейкоз (ALL). Исследователи из Лундского университета в Швеции в сотрудничестве с Karolinska Institutet, SciLifeLab и Кембриджским университетом в настоящее время провели самый обширный на сегодняшний день анализ ALL на уровне белка, изучая активность более 8 000 генов и белков. Результаты показывают аберрантное свертывание в цепочке ДНК, что, в свою очередь, влияет на активность генов. Это исследование было недавно опубликовано в Nature Communications.

Приблизительно у 25 процентов детей, у которых развивается ОЛЛ, есть форма лейкоза, которая характеризуется больными клетками, содержащими слишком много хромосом, известными как гипердиплоидия. Иногда в одной клетке обнаруживается до 67 хромосом.

«Ранее мы показали, что гены на дополнительных хромосомах контролируют развитие лейкемии, становясь более активными. Это вызывает дисбаланс в клетках, который, например, может затем начать делиться быстрее», – говорит Кайса Паулссон, сотрудник профессор Лундского университета и последний автор исследования.

Однако, точные механизмы на работе до сих пор неясны. В новом исследовании исследователи изучили активность более чем 8 000 генов и белков – то, что никогда ранее не делалось в этом масштабе для этой формы рака.
Преимущество изучения белков в том, что они более биологически актуальны. Если исследуется только уровень РНК, а затем транслируется на уровень белка, связь не совсем ясна, объясняет Кайса Паулссон.

«Это более новая область, и исследование уровней белка труднее, но преимущество заключается в том, что она дает нам лучшую картину того, как клетка контролируется, по сравнению только с изучением генов», – говорит Янне Лехтио, профессор в Каролинске Институт и соавтор исследования.

При гипердиплоидных лейкозах исследователи отметили более низкие уровни белка CTCF и белкового комплекса cohesin, которые контролируют укладку ДНК в клетке, по сравнению с лейкозами, которые не имеют дополнительных хромосом. Поэтому исследователи изучили, как ДНК свернута при гипердиплоидном лейкозе, и смогли наблюдать, что в некоторых случаях наблюдалось аберрантное складывание.

«Как складывается ДНК, важно для регуляции того, когда гены должны быть активными или нет. Мы также могли видеть, что у гипердиплоидных лейкозов были признаки нерегулируемых генов, что, вероятно, способствует возникновению заболевания», – говорит Кайса Паулссон.

Продолжающиеся исследования будут направлены на выявление доли ДНК, которая демонстрирует аберрантное свертывание. Результаты этого исследования важны для понимания того, как возникает гипердиплоидная лейкемия у детей и что движет раковым процессом.

«В настоящее время из-за обширного лечения с использованием химиотерапии уровень излечения детей с ОЛЛ составляет 90 процентов. В будущем мы надеемся, что сможем разработать еще лучшие методы лечения, которые обеспечат еще большую вероятность излечения и меньше побочных эффектов ", заключает Кайса Паулссон.

Источник:

https://www.lunduniversity.lu.se/article/first-major-study-of-proteins-in-patients-with-acute-lymphoblastic -leukaemia

      

Source link