На этой неделе (25 июля) проект «Геномика лекарственной чувствительности при раке» обнародовал результаты четырехлетнего интенсивного сбора и исследования данных, которые послужат основой для генетических исследований в области лечения рака во всем мире. Свободно доступный набор данных включает уникальные данные, сравнивающие ответы почти 1000 раковых клеточных линий на 453 лицензированных и экспериментальных препарата.

Проект, возглавляемый исследователями из Института Wellcome Sanger и Массачусетской больницы общего профиля, основан на исследовании, проведенном в предыдущие шесть лет, и практически удваивает объем новых данных, доступных на веб-сайте, что делает его крупнейшим общедоступным набором данных в своем роде. в мире.

Этот новый выпуск данных предоставляет количество свободно доступных данных на веб-сайте с открытым доступом к 453 соединениям для лечения рака, 989 линиям раковых клеток, 494 973 проверенным ассоциациям генома и 386 293 кривым зависимости дозы от препарата.

Предыдущее исследование уже позволило сделать открытия, которые привели к испытаниям лекарств ингибиторов PARP при раке костей у детей, напрямую способствовали разработке лекарств в фармацевтической промышленности и обеспечили проведение 70 научных исследований по всему миру. К наборам данных обращаются более 350 пользователей каждый день, и это будет увеличиваться с новым выпуском данных. Команда проекта надеется, что этот расширенный ресурс поможет обеспечить новые открытия и терапевтические возможности на долгие годы.

Проект «Геномика лекарственной чувствительности при раке» является новаторским государственно-частным партнерством, финансируемым Wellcome. Он объединяет образцы линий раковых клеток пациентов больниц с лицензированными и экспериментальными противораковыми препаратами от ряда фармацевтических компаний и применяет углубленное наблюдение и генетический анализ, чтобы определить, как основные изменения в ДНК человека влияют на то, как они будут реагировать на лечение. Конечная цель состоит в том, чтобы определить биомаркеры, которые можно было бы использовать в клинике для определения того, какие лекарства будут наиболее эффективны для лечения рака у пациента, на основе генетического профиля опухоли.

Работая вместе, Wellcome Sanger Institute (Великобритания) и Центр молекулярной терапии, Массачусетский центр общей онкологической больницы (США) исследовали образцы из 30 различных видов рака у взрослых и детей. Типы опухолей включают рак крови и солидные опухоли, первичные и метастатические, распространенные и редкие. Новые данные предоставляют богатый ресурс, позволяющий ученым, занимающимся раком, узнать больше о том, как работают раковые клетки, как они реагируют на лечение, а также генерировать новые терапевтические и лекарственные комбинации.

Теперь часть проекта Карты зависимостей от рака (Cancer DepMap), обширный набор данных доступен на http://www. Cancerxgene. org веб-сайте.

Мэтью Гарнетт, со-руководитель проекта «Геномика лекарственной чувствительности при раке» и руководитель группы в Институте Wellcome Sanger, сказал:

Мы рады, что смогли создать и опубликовать эти ценные данные для мирового сообщества исследователей рака. Наша база данных «Геномика лекарственной чувствительности при раке» является крупнейшим в мире хранилищем информации о том, как основополагающий геномный ландшафт рака влияет на его реакцию на лечение рака. Мы надеемся, что это даст новое понимание, которое укажет на новые способы нацеливания и лечения отдельных опухолей ».

У команды есть дальнейшие выпуски данных, запланированные на ближайшее будущее.